2011年7月，黄雅琼首次代表国家队参加国际赛事亚洲青年羽毛球锦标赛，助国家队赢得混合团体赛冠军；然而，由于球队以区冬妮/熊芮为星空体育官方网址女双主力，她仅能在对阵叙利亚时上阵过一场，赛后她表示“自己就打了一场球，还是对那么弱的对手，总觉得自己这块金牌是‘捡’来的。

　　2013年7月，黄雅琼出战美国黄金大奖赛，分别与于小含和王懿律搭档打进女双和混双决赛，但最终都不敌对手，仅得两项亚军；一周后，她又与于小含打进加拿大大奖赛女双决赛，并以2比1（11-21、21-11、21-13）反胜荷兰组合，夺得职业生涯首个大奖赛冠军；同年12月1日，2013年澳门羽毛球大奖赛，鲁凯/黄雅琼以2-1战胜崔率圭/蔡侑玎，夺得混双冠军。

　　2016年3月8日，2016年德国羽毛球公开赛，黄雅琼/汤金华以2-0战胜普缇塔/沙西丽，夺得女双冠军；同年6月12日，2016年澳大利亚羽毛球公开赛，黄雅琼/鲁恺以2-0战胜郑思维/陈清晨，获得混双冠军，这也是鲁恺/黄雅琼第二次拿到超级赛的混双冠军。

　　2022年12月，黄雅琼携手郑思维出战世界羽联总决赛，在决赛中以21-19、18-21、21-13战胜德差波/沙西丽，夺得本赛季继亚锦赛、泰国公开赛、印尼大师赛、印尼公开赛、大马赛、大马大师赛、世锦赛、丹麦公开赛、法国公开赛之后混双第十冠。

　　2024年8月2日，黄雅琼搭档郑思维在巴黎奥运会羽毛球赛决赛上以21-8,21-11击败韩国组合金元浩/郑那银夺得个人生涯首枚奥运金牌，同时首次创下混双大满贯成就，继张军/高崚、张楠/赵芸蕾、通托维·艾哈迈德/利利亚纳·纳西尔之后世界羽坛第四对混双大满贯组合。